Desde hace aproximadamente dieciséis años se lleva a cabo la recuperación de especies animales protegidas por la Ley.
      En algunos casos se trata de mamíferos o reptiles que luego de ser atendidos y preparados físicamente son asilvestrados y devueltos a su medio natural en sitios que garanticen su supervivencia. y donde se evite en lo posible que sean heridos o capturados por el hombre, pretendiendo además dentro de lo posible que tengan la oportunidad de encontrar el alimento que necesitan.
      Como ejemplos podemos contar con la recuperación y puesta en libertad de jinetas, garduñas, zorros, tejones, galápagos etc., así como también la devolución al mar de distintas tortugas marinas, focas y aves marinas en lugares próximos a su hábitat, según la época del año, ya que la mayoría son migratorias.
      Dentro de este capítulo la tarea más importante es la recuperación de aves rapaces, tanto diurnas como nocturnas, que han llegado a este Zoológico recogidas por el público o por diferentes autoridades, y en colaboración con la Jefatura de Medio Ambiente Natural de Pontevedra (Centro de Coto Redondo) con el cuál se llevan a cabo estas tareas.
  En este período de tiempo transcurrido se han recuperado cerca de 150-200 aves rapaces diversas, dejando las inútiles, es decir las que no pueden ser devueltas a la naturaleza para ser observadas en el Zoo.
      Las lesiones más frecuentes padecidas por estas aves son producidas generalmente por armas de fuego, y en otros casos, por haber sido sometidas a largos períodos de cautiverio en sitios inadecuados, por particulares que las han cogido de pollos, ignorando cuál es la atención correcta que estos animales requieren y lo que es más grave, infringiendo la Ley que las protege.